据戴小枫研究员介绍,大丽轮枝菌是引起作物黄萎病的病原真菌,年均造成损失近百亿美元。该病原难以防控的重要原因是种群结构复杂,农业生产实践中缺少分子流行检测技术。针对这一难题,该团队联合国内外16家单位开展协同攻关,构建了迄今为止来源最丰富的菌种资源库,发起了“全球黄萎病菌基因组研究”计划。目前,团队已完成了基因组解析工作(全基因组159株、重测序3624株),搭建了Verticilli-Omics数据库1.0版本并开始线上运行。该数据库收录了来源10个国家26个寄主共8102份黄萎病菌菌种资源;释放了159个大丽轮枝菌全基因组数据,占目前全球已释放大丽轮枝菌基因组总数的85%;搭建了基因组可视化、基因功能检索、基因比对等分析平台。团队目前还在搭建Verticilli-Omics数据库2.0版本,主要展示全球大丽轮枝菌遗传变异组数据。
该研究得到国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项、中国农科院科技创新工程等项目支持。